MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013205	CTCG	2	8	79682	79689	0 %	25 %	25 %	50 %	258510081
1502	NC_013205	GCG	2	6	79710	79715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1503	NC_013205	AGC	2	6	79731	79736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1504	NC_013205	GAT	2	6	79739	79744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1505	NC_013205	CAC	2	6	79790	79795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510081
1506	NC_013205	GCG	2	6	79796	79801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1507	NC_013205	AGCGCG	2	12	79848	79859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510081
1508	NC_013205	CGG	2	6	79919	79924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1509	NC_013205	CGG	2	6	79945	79950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1510	NC_013205	CCG	2	6	79974	79979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510081
1511	NC_013205	GGATGA	2	12	79990	80001	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	258510081
1512	NC_013205	GAT	2	6	80009	80014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1513	NC_013205	ATC	2	6	80025	80030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510081
1514	NC_013205	ATC	2	6	80049	80054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510081
1515	NC_013205	GC	4	8	80059	80066	0 %	0 %	50 %	50 %	258510081
1516	NC_013205	ATG	2	6	80097	80102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1517	NC_013205	GAT	2	6	80108	80113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1518	NC_013205	TGA	2	6	80146	80151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1519	NC_013205	CAG	2	6	80228	80233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1520	NC_013205	GAC	2	6	80336	80341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1521	NC_013205	GTG	2	6	80343	80348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510081
1522	NC_013205	ACGGC	2	10	80350	80359	20 %	0 %	40 %	40 %	258510081
1523	NC_013205	GC	3	6	80371	80376	0 %	0 %	50 %	50 %	258510081
1524	NC_013205	CCAC	2	8	80433	80440	25 %	0 %	0 %	75 %	258510081
1525	NC_013205	TGA	2	6	80452	80457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1526	NC_013205	TCC	2	6	80490	80495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510081
1527	NC_013205	CGC	2	6	80514	80519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510081
1528	NC_013205	GCG	2	6	80526	80531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1529	NC_013205	AGAA	2	8	80556	80563	75 %	0 %	25 %	0 %	258510081
1530	NC_013205	AAT	2	6	80564	80569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510081
1531	NC_013205	GTC	2	6	80624	80629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510082
1532	NC_013205	TGT	2	6	80638	80643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510082
1533	NC_013205	TGA	2	6	80656	80661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510082
1534	NC_013205	GAT	3	9	80669	80677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510082
1535	NC_013205	ACC	3	9	80788	80796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510082
1536	NC_013205	GCG	2	6	81128	81133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1537	NC_013205	GCC	2	6	81146	81151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1538	NC_013205	CGATG	2	10	81163	81172	20 %	20 %	40 %	20 %	258510083
1539	NC_013205	CAC	2	6	81173	81178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510083
1540	NC_013205	GGCCTC	2	12	81287	81298	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510083
1541	NC_013205	GCC	2	6	81342	81347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1542	NC_013205	AGG	2	6	81363	81368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510083
1543	NC_013205	CAT	2	6	81374	81379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510083
1544	NC_013205	CGG	2	6	81416	81421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1545	NC_013205	GGC	2	6	81482	81487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1546	NC_013205	TCG	2	6	81621	81626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1547	NC_013205	GCGA	2	8	81631	81638	25 %	0 %	50 %	25 %	258510083
1548	NC_013205	GTC	2	6	81663	81668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1549	NC_013205	GGC	2	6	81739	81744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1550	NC_013205	GGCGC	2	10	81760	81769	0 %	0 %	60 %	40 %	258510083
1551	NC_013205	GGA	2	6	81784	81789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510083
1552	NC_013205	CGT	2	6	81853	81858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1553	NC_013205	TCG	2	6	81915	81920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1554	NC_013205	CGA	2	6	81943	81948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1555	NC_013205	CGA	2	6	81967	81972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1556	NC_013205	CGG	2	6	81991	81996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1557	NC_013205	CGC	2	6	82030	82035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1558	NC_013205	TCG	2	6	82110	82115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
1559	NC_013205	CG	3	6	82122	82127	0 %	0 %	50 %	50 %	258510083
1560	NC_013205	GA	3	6	82206	82211	50 %	0 %	50 %	0 %	258510083
1561	NC_013205	GCGAG	2	10	82213	82222	20 %	0 %	60 %	20 %	258510083
1562	NC_013205	GAG	2	6	82235	82240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510083
1563	NC_013205	GCC	2	6	82285	82290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1564	NC_013205	GC	3	6	82325	82330	0 %	0 %	50 %	50 %	258510083
1565	NC_013205	CGG	2	6	82345	82350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1566	NC_013205	GCG	2	6	82398	82403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1567	NC_013205	GTGC	2	8	82427	82434	0 %	25 %	50 %	25 %	258510083
1568	NC_013205	CGAG	2	8	82435	82442	25 %	0 %	50 %	25 %	258510083
1569	NC_013205	TGG	2	6	82522	82527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510083
1570	NC_013205	CGC	2	6	82532	82537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1571	NC_013205	GCC	2	6	82557	82562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1572	NC_013205	CA	3	6	82563	82568	50 %	0 %	0 %	50 %	258510083
1573	NC_013205	AGA	2	6	82573	82578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510083
1574	NC_013205	GCC	2	6	82594	82599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1575	NC_013205	GAA	2	6	82619	82624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510083
1576	NC_013205	GCG	2	6	82745	82750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1577	NC_013205	GCG	2	6	83065	83070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510084
1578	NC_013205	ACC	2	6	83202	83207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1579	NC_013205	CGAGG	2	10	83227	83236	20 %	0 %	60 %	20 %	258510084
1580	NC_013205	GCG	2	6	83267	83272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510084
1581	NC_013205	GC	3	6	83283	83288	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1582	NC_013205	AGA	2	6	83294	83299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510084
1583	NC_013205	GC	3	6	83410	83415	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1584	NC_013205	ATC	2	6	83417	83422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510084
1585	NC_013205	CAC	2	6	83461	83466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1586	NC_013205	GTC	2	6	83467	83472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1587	NC_013205	CGC	2	6	83496	83501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1588	NC_013205	CGAGC	2	10	83511	83520	20 %	0 %	40 %	40 %	258510084
1589	NC_013205	GTC	2	6	83530	83535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1590	NC_013205	GGC	2	6	83583	83588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510084
1591	NC_013205	CCGC	2	8	83606	83613	0 %	0 %	25 %	75 %	258510084
1592	NC_013205	GAA	2	6	83671	83676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510084
1593	NC_013205	GAG	2	6	83695	83700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510084
1594	NC_013205	TCG	2	6	83793	83798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1595	NC_013205	CGC	2	6	83836	83841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1596	NC_013205	GCCC	2	8	83887	83894	0 %	0 %	25 %	75 %	258510084
1597	NC_013205	CG	3	6	83914	83919	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1598	NC_013205	CAC	2	6	83920	83925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1599	NC_013205	CCG	2	6	83976	83981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1600	NC_013205	CTGTG	2	10	83988	83997	0 %	40 %	40 %	20 %	258510084
1601	NC_013205	ACG	2	6	84011	84016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1602	NC_013205	GA	3	6	84041	84046	50 %	0 %	50 %	0 %	258510084
1603	NC_013205	GC	3	6	84085	84090	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1604	NC_013205	CAC	2	6	84094	84099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1605	NC_013205	CGGC	2	8	84108	84115	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1606	NC_013205	CG	3	6	84118	84123	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
1607	NC_013205	GCC	2	6	84140	84145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1608	NC_013205	CGC	2	6	84214	84219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1609	NC_013205	CTC	2	6	84400	84405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510085
1610	NC_013205	CAA	2	6	84453	84458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510085
1611	NC_013205	GAA	3	9	84477	84485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510085
1612	NC_013205	TCA	2	6	84644	84649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
1613	NC_013205	CGT	2	6	84692	84697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510085
1614	NC_013205	CGA	2	6	84701	84706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510085
1615	NC_013205	CTA	2	6	84741	84746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
1616	NC_013205	GCAC	2	8	84830	84837	25 %	0 %	25 %	50 %	258510085
1617	NC_013205	CAT	3	9	84873	84881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
1618	NC_013205	GC	3	6	84902	84907	0 %	0 %	50 %	50 %	258510085
1619	NC_013205	CGA	2	6	84969	84974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510085
1620	NC_013205	GAAG	2	8	84979	84986	50 %	0 %	50 %	0 %	258510085
1621	NC_013205	CAC	2	6	84991	84996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510085
1622	NC_013205	CATCCG	2	12	85017	85028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510085
1623	NC_013205	GAG	2	6	85048	85053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510085
1624	NC_013205	CGCCAC	2	12	85098	85109	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258510085
1625	NC_013205	CAT	2	6	85125	85130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
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